As questões de segurança que o Android tem não são propriamente apenas devido ao pessoal lhe fazer rooting. Mas, de qualquer forma, é uma coisa que não é feita por toda a gente. De facto, a vasta maioria dos utilizadores não precisa de fazer rooting ao telemóvel (o que é verdadeiramente um problema de segurança quando pessoas que não percebem o que estão a fazer o fazem).
Tu consegues perfeitamente aproveitar o potencial do iOS. E mais eficientemente. É mais fácil e rápido desenvolver aplicações para iOS que para Android. E não estou apenas a falar de testar para as milhares de configurações que podem existir, mas também da falta de ferramentas apropriadas para o desenvolvimento.
Isso de um ser proprietário e o outro ser aberto é irrelevante. O negócio gerado em torno da plataforma (que é várias vezes superior ao gerado em torno do Android - mesmo tendo uma quota de mercado superior ao iOS) prova que o ecossistema foi bem construído. Caso contrário continuaríamos a assistir à completa pirataria de software, como tem acontecido desde que a internet se tornou num meio suficientemente acessível. O negócio que há em torno da App Store é que possibilita muito do desenvolvimento para outras plataformas.
De facto, relativamente à abertura dos sistemas, se o Google quiser, pode fechar as próximas versões do sistema operativo (tal como qualquer um pode pegar no Android aberto actualmente e criar uma versão proprietária do sistema). A licença de software que foi colocada por eles é suficiente permissiva para que isto possa ser feito.