Boas,
Isso é uma operação um bocado complicada.
Para começar tens tudo o que está em "meus documentos". Tudo isso podes passar livremente para o disco D.
Quanto a pastas do sistema, a pasta "Windows" como é óbvio, está excluida de poder ser transferida.
As pastas dos programas também não podes passar para o D. O que podes fazer, é alguns programas, especialmente os que ocupam mais espaço, e se tiveres os ficheiros de instalação, desinstalar do disco c e instalar novamente no disco d. Agora não podes simplesmente copiar os ficheiros dum disco para o outro porque senão todas as referências presentes no registo vão ao ar e deixas de conseguir correr os programas.
Boa sorte,